硬盘盒的协议实际上指的是硬盘盒支持什么协议的硬盘，一般硬盘盒的协议与硬盘协议一样，主要分为接口协议和传输协议两种：
1、接口协议
接口协议，也就是SSD硬盘的主要分类方式，按照接口来分类通常分为SATA、SATA-E、mSATA、M.2、U.2、PCI-E、Macbook专用接口等几种，其中应用最广泛的是SATA、mSATA、M.2、PCI-E这几种，而实际上严格来讲，就只有SATA和PCI-E这两种，因为mSATA用的也是SATA协议，只是因为接口是迷你版，而M.2分为SATA和PCI-E两种，所以实际上还是SATA和PCI-E的较量。
2、传输协议
传输协议主要分为两种：
（1）AHIC传输协议
AHCI（Serial ATA Advanced Host Controller Interface）串行ATA高级主控接口/高级主机控制器接口，是用来替代上一代IDE的。本质上讲还都是基于机械硬盘的设计，所以已经逐渐被淘汰，目前的主流SSD产品在安装前一定要在BIOS设置中打开AHCI模式才可以将性能发挥到最大，许多用户安装了SSD产品后发现速度只有300MB/s不到400，大部分是因为没有开启AHCI模式。
现在所用的SATA接口与AHCI标准其实是为高延时的机械硬盘而设计的，目前主流SSD依然继续使用它们，早期SSD性能不高时可能还不觉得有什么问题，但是随着SSD的性能逐渐增强，这些标准已经成为限制SSD的一大瓶颈，专为机械硬盘而设计的AHCI标准并不太适合低延时的SSD。
（2）NVMe传输协议
NVMe (Non-Volatile Memory express)，是一种建立在M.2接口上类似AHCI的一种协议，是专门为闪存类存储设计的协议。就是因为大家发现AHCI标准并不适合低延时的SSD产品，所以为了解放SSD的性能，重新制定了新的存储规范标准，使用PCI-E通道，目前的高速SSD产品都必须支持NVMe协议才行，而速度普遍都在2000MB/s以上，性能出色的可以轻松超过3000MB/s。
NVMe其实与AHCI一样都是逻辑设备接口标准。不同于AHCI，NVMe是使用PCI-E通道的SSD一种规范，NVMe的设计之初就有充分利用到PCI-E SSD的低延时以及并行性，还有当代处理器、平台与应用的并行性。SSD的并行性可以充分被主机的硬件与软件充分利用，相比与现在的AHCI标准，NVMe标准可以带来多方面的性能提升。
NVMe的一大优势就是低延迟。这主要是因为流线型的存储堆栈，NVMe无需读取寄存器就可以发出命令。AHCI的每个命令都需要读取4个不可缓存寄存器，从而导致大约2.5μs的额外延迟。低延时和良好的并行性的优势就是可以让SSD的随机性能得到大幅度提升，在任何队列深度下都能发挥出极佳的速度。
